Alaina Huffman nasceu em Vancouver, Colúmbia Britânica, Canadá. Ela também viveu nos arredores de Ottawa, Ontario, onde estudou na Goulbourn Middle School. Aos 13 anos, Huffman foi a sua primeira audição para um piloto da Fox Family Channel. Apesar da concorrência, lhe foi oferecido o papel principal. No entanto, uma agência de modelos contratou Huffman e ela se tornou modelo em desfiles de moda na Europa e Japão nos anos seguintes.

Quando o pai se mudou para Dallas, viu a oportunidade de viver no Estados Unidos e se inscrever na faculdade, deixando para trás a modelagem. Enquanto estudava, ela assumiu papéis em vários filmes independentes. Eventualmente, ela se mudou para Los Angeles, onde acrescentou mais créditos de televisão ao seu currículo.

Casada com John Henry Huffman IV, desde 31 de dezembro de 2003, com quem têm quatro filhos: dois meninos, Elijah e Lincoln Julius, e duas meninas, Hanna e a mais nova, Charley-Jane, nascida a 08 dezembro de 2009. 

A última gravidez coincidiu com a primeira temporada de Stargate: Universe, e foi colocada no enredo. Em 16 de agosto de 2011, ela anunciou no Twitter que estava há espera de um quarto filho para chegar em dezembro de 2011. Mais tarde, ela anunciou no Twitter que ela havia dado à luz a um menino chamado Lincoln, em 15 de dezembro de 2011.